分体插入式电磁流量计的安装与调试比其它流量计复杂，且要求更严格。变送器和转换器必须配套使用，两者之间不能用两种不同型号的仪表配用。在安装变送器时，从安装地点的选择到具体的安装调试，都必须按照产品安装使用说明规范操作。因此在使用过程中，要特别注意外界环境的不良因素对于分体式电磁流量计测量状况的影响。
1、电源问题。
由于分体插入式电磁流量计要外接电源，造成室外安装不方便，也限制了分体式电磁流量计在郊区管网的使用。另外，分体式电磁流量计不自带电源，一旦断电，将造成用作结算水表的流量计数据缺失，这样对其断电时段缺失水量的计量与推算也就提出了新的问题，一般供水企业与用户都是个案商量处理，增加了不少工作量。若分体式电磁流量计能自带电源，就能从根本上解决这一问题，也将促进其在结算水表中的推广应用。而现在都可以使用锂电池供电，解决了这个问题
2、防雷问题。
不管是结算水表还是区域计量的分体式电磁流量计，在较为空旷的郊区，特别是在雷雨天气覆盖面积较大的地区，分体式电磁流量计的防雷是一个比较严峻的考验。在严格做好接地、电源保护后，在空旷地区安装的分体式电磁流量计被雷击的概率还是很高。所以简单有效的办法是提高流量计自身的防雷性能，如不能根本性解决，则应对其内部电路进行分离保护，这样即使雷击损坏，也能降低更换成本